工信部威海电子信息技术综合研究中心下设综合处、发展规划处、基础技术研究室、智能制造研究室、公共服务与信息安全研究室。
下属机构为威海神舟信息技术研究院、威海赛宝工业信息技术研究院有限公司、山东海洋信息技术研究院、威海赛宝工业信息技术研究院有限公司、产促中心山东分中心(筹)。